Bộ truyện này xoay quanh cuộc phiêu lưu của ba cậu học sinh và hàng xóm được gọi là Bộ ba nhỏ: Pynotaro Tezuka, Tsubame Azuma và Hiroshi Ochanomizu. Một ngày nọ, họ đến thăm giáo viên của mình, người đã cho họ mượn một đĩa PS5 (ông chỉ có máy chơi game cũ hơn) mà ông nói rằng liên kết đến một thế giới khác. Pynotaro thử đĩa trong nhà của mình và hình ảnh hiển thị là một công viên tươi tốt. Cảnh quan này hoàn toàn trái ngược với thế giới của riêng họ. Bản thân những cậu bé sống trong một thế giới mà chúng ta coi là giống như phim hoạt hình, với con người có chất lượng chibi đối với họ. Thế giới trên màn hình trông giống thế giới của chúng ta hơn nhiều.Trong khi các chàng trai đi vắng, em gái của Pynotaro là Futaba nhìn thấy một con côn trùng bay ra khỏi màn hình, vẫn giữ nguyên vẻ ngoài chân thực của nó. Đến lượt mình, cô trèo lên màn hình TV và lang thang khắp thế giới thực tế, nhưng vẫn giữ nguyên vẻ ngoài hoạt hình của mình. Khi cô va vào những người ở thế giới này, tất cả họ đều chụp ảnh cô vì họ nghĩ cô là một nhân vật anime sống động.Một trong những người chụp ảnh cao hơn nhiều so với những người còn lại, và thực sự không giống người. Khi Futaba nhìn lên trên, cô thấy một tàu vũ trụ khổng lồ trên bầu trời. Con tàu tấn công, tạo ra tiếng động cảnh báo cho Small Three, những người vào bên trong TV để điều tra. Ở đó, Pynotaro chứng kiến Futaba bị những người trên tàu vũ trụ bắt đi. Anh ta đuổi theo, bám vào con tàu khi nó bay lên bầu trời một lần nữa, nhưng rơi xuống, dường như là tử vong.Nhưng Pynotaro không chết. Anh ta đâm sầm xuống đất mà không hề bị thương. Anh ta, Tsubame và Hiroshi phát hiện ra rằng trong thế giới này, cơ thể của họ cực kỳ khỏe, vì vậy họ có thể chạy nhanh, nhảy cao và sống sót sau mọi cuộc tấn công. Pynotaro quyết tâm đưa Futaba trở lại, vì vậy họ ở lại thế giới mới này. Họ biết rằng về mặt cấu trúc, bố cục của thế giới này giống như thế giới của họ, vì vậy họ đến nhà của chính mình và gặp gỡ những bản ngã song song của họ, ở lại như những phần đối trọng thực tế, thay thế của họ. Trong thời gian này, họ biết rằng năm tháng trước, thế giới này đã được một chủng tộc người ngoài hành tinh đến thăm và chiếm giữ tàu vũ trụ. Họ nói rằng họ đã đến trong hòa bình, nhưng không phải ai cũng tin tưởng họ và chẳng mấy chốc, Small Three gặp phải vấn đề với những vị khách ngoài hành tinh này.
Nhưng Pynotaro không chết. Anh ta đâm sầm xuống đất mà không hề bị thương. Anh ta, Tsubame và Hiroshi phát hiện ra rằng trong thế giới này, cơ thể của họ cực kỳ khỏe, vì vậy họ có thể chạy nhanh, nhảy cao và sống sót sau mọi cuộc tấn công. Pynotaro quyết tâm đưa Futaba trở lại, vì vậy họ ở lại thế giới mới này. Họ biết rằng về mặt cấu trúc, bố cục của thế giới này giống như thế giới của họ, vì vậy họ đến nhà của chính mình và gặp gỡ những bản ngã song song của họ, ở lại như những phần đối trọng thực tế, thay thế của họ. Trong thời gian này, họ biết rằng năm tháng trước, thế giới này đã được một chủng tộc người ngoài hành tinh đến thăm và chiếm giữ tàu vũ trụ. Họ nói rằng họ đã đến trong hòa bình, nhưng không phải ai cũng tin tưởng họ và chẳng mấy chốc, Small Three gặp phải vấn đề với những vị khách ngoài hành tinh này.
Nhìn chung, thật khó để nói
Thunder 3 có cảm giác như thế nào ở giai đoạn đầu này. Với hầu hết cốt truyện tập trung vào việc giải thích tiền đề của câu chuyện, chúng ta không thể thực sự biết nó hay hay dở cho đến khi chúng ta đọc sâu hơn. Tuy nhiên, các phong cách nghệ thuật tương phản có nghĩa là bạn ít nhất cũng nên có được thứ gì đó độc đáo hơn một chút so với hầu hết các câu chuyện isekai.